食人鱼在自然界的天敌有很多,包括有:白鹭,鸬,苍鹭.另外有鳄鱼(凯门鳄),水獭,淡水海豚。大条鲶鱼,以及同类互食,疾病,等等。再加上每年当地"土人"大量捕捉及旱灾.。令食人鱼在自然界不量减小,甚至有些品种已经非常罕有。

天敌有水鸟、凯门鳄、巨獭、淡水海豚等。天敌是指自然界中某种动物专门捕食或危害另一种动物，而这几种都是会捕食食人鱼的，所以几种都是食人鱼的天敌。食人鲳，也称食人鱼，是分布于南美洲亚马逊河中的一种鱼，是水虎鱼的一种，水虎鱼有近56种，属脂鲤科中的锯鲑脂鲤亚科。

刺鲶则善于利用它的锐利棘刺，一旦被食人鱼盯上了，它就以最快速度游到最底下的一条食人鱼腹下，不管食人鱼怎样游动，它都与之同步动作。食人鱼要想对它下口，刺鲶马上脊刺怒张，使食人鱼无可奈何。而且在亚马逊河杀手排行榜上刺鲶排第一，食人鱼只排在第四。